Gene Runner是一款十分不錯的 基因序列分析軟件。這款軟件為生物學(xué)家提供了多種分析方式，確保分析結(jié)果百分百準確，為生物研究做出巨大的貢獻。本站提供的是該軟件的英文安裝版本，需要的朋友快來本站下載使用吧！

軟件介紹

生物基因分析Gene Runner是一個專業(yè)的應(yīng)用，為遺傳學(xué)家和生物學(xué)家提供了可靠的工具，可以幫助他們進行基因分析提供方便。

該應(yīng)用程序需要包含遺傳信息序列格式的文件，然后可以使用“ORF”(開放閱讀框)按鈕，使用戶能夠設(shè)置首選核苷酸或氨基酸大小，以及選擇“轉(zhuǎn)換表”分析一起工作。開的ORF項目后，用戶可進行各種注釋為每個條目。

在'序列和雜交分析“功能允許用戶顯示所選擇的DNA部分的引物的特性，或放棄某些類型的引物。

基因轉(zhuǎn)輪保存在表格上氨基酸的信息和該數(shù)據(jù)也可與“蛋白質(zhì)分析”函數(shù)中，“抑制”和“轉(zhuǎn)換表'使用。這是必需的作為基因轉(zhuǎn)輪將發(fā)送一個錯誤消息，如果使用的氨基酸未在所述表格中定義的。此外，關(guān)于這些元素的所有信息是可編輯的，這樣用戶就可以充分地調(diào)整自己的價值觀。

軟件功能

1、查找：在此框中輸入查詢序列。查詢序列可能包含IUPAC通配符。堿基或氨基酸總數(shù)顯示在查詢框右側(cè)的框中。也可以使用shift+ins或ctrl+v鍵從剪貼板粘貼查詢序列(打開對話框窗口時，不能使用菜單中的編輯粘貼)。這個發(fā)現(xiàn)只接受一個字母的氨基酸代碼。在一個或三個字母的代碼顯示中可以找到合適的氨基酸。如果find以前用于當前序列，請鍵入以前搜索的文本。每個序列都有自己的查找內(nèi)存。

2、主題：當搜索設(shè)置為蛋白質(zhì)時，單擊向下箭頭顯示Prosite主題的下拉列表。有關(guān)prosite及其序列約定的說明，請參見下文。當設(shè)置為核酸時，將顯示核酸基序列表。選擇所需的主題。然后，Motif會自動輸入find:框中。此特征允許識別TATA盒、AP1結(jié)合位點、N-糖基化位點等。

3、類型：確定執(zhí)行的搜索類型：標準、主題或不匹配。

4、標準是對在“查找：”框中輸入的查詢序列的正常搜索。用于簡單搜索或核酸搜索，所有堿基/氨基酸必須完全匹配。

5、motif是在motif框中搜索查詢序列，或使用prosite約定在find:框中輸入的序列，請參見下文。蛋白質(zhì)和核酸的基序可以以相同的慣例輸入。注意：此搜索比標準搜索慢。

6、mismatch<=將搜索設(shè)置為不匹配，并設(shè)置查詢序列中不匹配堿基/氨基酸的最大數(shù)目。默認設(shè)置為查詢序列長度/5。stk>=設(shè)置不匹配搜索中相鄰堿基/氨基酸(一個堆棧)的最小數(shù)目。默認設(shè)置為查詢序列長度/2。與不匹配參數(shù)一起使用，以微調(diào)搜索。例如，如果將不匹配設(shè)置為4，并且在18個低聚物上將STK設(shè)置為6，則所找到的序列必須至少包含6個連續(xù)的完全匹配堿基，并且總共不超過4個不匹配堿基。當“全部顯示”命令處于活動狀態(tài)時，所有不匹配的序列都將突出顯示。用于檢查雜交探針、測序引物等，以確定假啟動部位。

7、find僅搜索活動序列中第一個出現(xiàn)的查詢序列。光標位于查詢序列的5'堿基(或蛋白質(zhì)中的氨基末端)，查詢序列突出顯示。搜索從光標位置開始到序列結(jié)束。即使查詢序列擴展到循環(huán)序列開始和結(jié)束之間的“joint”上，也會找到該查詢序列。狀態(tài)欄顯示找到序列的第一個和最后一個堿基或氨基酸的位置。要再次搜索查詢序列的另一個匹配項，請在“編輯”菜單下選擇“再次查找”?？旖萱I是F6。“再次查找”按鈕位于工具欄中“查找”按鈕旁邊。

軟件特點

1、格式化多行復(fù)制

2、EZ Clone - 解決復(fù)雜克隆問題的簡單方法

3、查看ABI文件 - 單個序列或多個ABI文件的對齊

4、動態(tài)搜索 - 在編輯序列時自動搜索和突出顯示

Gene Runner安裝教程

1、首先在腳本之家網(wǎng)站下載Gene Runner v6.5.51安裝包，雙擊打開

2、選擇安裝位置

3、正在安裝，請稍等

4、完成安裝，打開軟件

5、進入軟件主界面