Primer Premier是一款由Premier公司推出的專業(yè)的引物設(shè)軟件，用來(lái)幫助研究人員設(shè)計(jì)最適合引物的應(yīng)用軟件，這是一款經(jīng)典的版本，Primer Premier支持win7 操作系統(tǒng)，具有PCR或測(cè)序引物以及雜交探針設(shè)計(jì)功能，本平臺(tái)提供Primer Premier 64位免費(fèi)版，需要的朋友可以下載！

軟件特色

1、Primer Premier 64位主要界面是分為序列編輯窗口(Genetank)，引物設(shè)計(jì)窗口(Primer Design)，酶切分析窗口(Restriction Sites)和紋基分析窗口(Motif)。
2、該軟件就是用來(lái)進(jìn)行引物設(shè)計(jì)的。
3、可以簡(jiǎn)單地通過(guò)手動(dòng)拖動(dòng)鼠標(biāo)以擴(kuò)增出相應(yīng)片段所需的引物。
4、在手動(dòng)的任何時(shí)候，下面顯示各種參數(shù)的改變和可能的二聚體、異 二聚體、發(fā)夾結(jié)構(gòu)等。也可以給定條件，讓軟件自動(dòng)搜索引物，并將引物分析結(jié)果顯示出來(lái)。
5、而且進(jìn)行這些操作非常簡(jiǎn)單。

新功能

1、新改進(jìn)的搜索算法

新改進(jìn)的搜索算法。

自動(dòng)避免同源性和模板結(jié)構(gòu)。

序列視圖，用于可視化序列上的引物。

新改進(jìn)的圖形用戶界面。

2、自動(dòng)序列檢索

使用登錄/GI 編號(hào)和檢測(cè) ID 從 GenBank 和 dbSNP 直接快速檢索序列批次到程序中。使用多重檢索工具，可以從本地驅(qū)動(dòng)器加載序列。

3、自動(dòng)同源性和模板結(jié)構(gòu)規(guī)避

引物特異性可以通過(guò)執(zhí)行BLAST搜索和從程序中搜索模板結(jié)構(gòu)來(lái)實(shí)現(xiàn)。在設(shè)計(jì)引物時(shí)，會(huì)使用這兩種檢索的結(jié)果。在引物設(shè)計(jì)過(guò)程中，會(huì)自動(dòng)避開(kāi)表現(xiàn)出顯著交叉同源性和模板結(jié)構(gòu)的區(qū)域。

4、評(píng)估預(yù)先設(shè)計(jì)的引物

Primer Premier對(duì)預(yù)先設(shè)計(jì)的引物進(jìn)行分析和評(píng)估，并對(duì)其進(jìn)行排序，以便您判斷引物與所需目標(biāo)值的距離。如果您正在使用已發(fā)布或預(yù)先設(shè)計(jì)的經(jīng)過(guò)充分驗(yàn)證的引物，此功能特別有用。還可以評(píng)估多達(dá) 5 個(gè)錯(cuò)配的引物。

對(duì)于特定的底漆，Primer Premier甚至可以設(shè)計(jì)出兼容的套裝。例如，對(duì)于預(yù)先設(shè)計(jì)或發(fā)布的正向引物，Primer Premier可以找到符合所有設(shè)計(jì)標(biāo)準(zhǔn)的兼容反向引物。

您可以評(píng)估正向/反向引物或引物對(duì)，甚至無(wú)需輸入模板序列。Primer Premier顯示所分析寡核苷酸的所有特性，并以HTML或csv文件格式導(dǎo)出。對(duì)引物進(jìn)行排序，使您能夠判斷它們與目標(biāo)值的接近程度。

5、手動(dòng)引物搜索

Primer Premier 可在用戶手中完全控制底漆設(shè)計(jì)。使用手動(dòng)引物搜索選項(xiàng)，用戶可以單擊模板序列上的任何核苷酸，以在他們選擇的位置獲得引物。Primer Premier設(shè)計(jì)了一種引物，其3'端位于該核苷酸上，并立即分析其性質(zhì)。引物的長(zhǎng)度也可以根據(jù)用戶的方便增加/減少。對(duì)于誘變和克隆，此功能有助于在其他受限區(qū)域內(nèi)獲得最佳設(shè)計(jì)。Primer Premier能夠沿著DNA序列“滑動(dòng)”引物序列，實(shí)時(shí)顯示其特性，使用戶能夠可視化定位寡核苷酸的最佳位置。

6、編輯模板序列

可以編輯模板序列?？梢允褂脴?biāo)準(zhǔn)的剪切/復(fù)制/粘貼功能修改基底，以將感興趣的位置歸零。不需要的序列區(qū)域可以通過(guò)選擇它們并單擊“刪除”來(lái)刪除。該程序還允許用戶為序列添加注釋或注釋以供將來(lái)參考。

7、序列視圖

所選序列可以以每塊 3 或 10 個(gè)堿基、單鏈或雙鏈進(jìn)行查看。設(shè)計(jì)引物有標(biāo)記，意義引物為藍(lán)色，反義引物為紅色。選定的 SNP 標(biāo)記為粉紅色。同源區(qū)域以黃色突出顯示，參與模板結(jié)構(gòu)的堿基帶有下劃線。您可以將“序列視圖”與引物設(shè)計(jì)結(jié)果一起導(dǎo)出為csv或HTML格式。

8、生成報(bào)告

您可以為實(shí)驗(yàn)室筆記本和與同事共享信息而設(shè)計(jì)的檢測(cè)創(chuàng)建演示質(zhì)量報(bào)告。該報(bào)告可視化了引物在序列上的位置，包括替代引物的列表，顯示引物、擴(kuò)增子和序列屬性以及引物設(shè)計(jì)程序使用的設(shè)計(jì)參數(shù)。

9、本地和桌面 BLAST 選項(xiàng)

您可以使用“本地”和“桌面 BLAST”選項(xiàng)針對(duì)本地自定義數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)序列進(jìn)行 BLAST。在計(jì)算機(jī)上創(chuàng)建文本或 FASTA 格式的序列數(shù)據(jù)庫(kù)，然后從 Primer Premier 中打開(kāi)查詢序列。然后將結(jié)果用于引物設(shè)計(jì)。如果您不想在 Internet 上提交數(shù)據(jù)，或者您正在處理未發(fā)布的信息，則此支持特別有用。

10、計(jì)算器

內(nèi)置計(jì)算器可計(jì)算 GC%，顯示堿基計(jì)數(shù)，并使您能夠獲得互補(bǔ)和反向互補(bǔ)鏈。

11、數(shù)據(jù)和數(shù)據(jù)庫(kù)管理

可以創(chuàng)建多個(gè)項(xiàng)目。通過(guò)為每個(gè)實(shí)驗(yàn)創(chuàng)建單獨(dú)的項(xiàng)目，可以輕松管理多個(gè)實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)。維護(hù)序列信息和搜索結(jié)果的本地?cái)?shù)據(jù)庫(kù)。

安裝說(shuō)明

安裝Primer Premier 6

（比如你放到D盤）解壓crack，看里面有一個(gè)crack的txt文件，打開(kāi)，按照上面的說(shuō)明來(lái)操作：
1.把crack這整個(gè)壓縮包剪切到 這個(gè)目錄下：
D:\Program Files\Primer Premier 6.0\http\Dwww.premierbiosoft.com\P80\DMIUpdater\DMPP\DM600
2.然后從電腦的“開(kāi)始”中找到運(yùn)行，或直接按“windows+R”，輸入cmd，打開(kāi)dos系統(tǒng)
3.輸入d: 回車
4.然后輸入（鼠標(biāo)右鍵粘貼）
cd D:\Program Files\Primer Premier 6.0\http\Dwww.premierbiosoft.com\P80\DMIUpdater\DMPP\DM600 回車
5.再輸入“java -jar patcher.jar”回車