Python如何用字典完成匹配任務
更新時間：2024年09月13日 09:34:18 作者：小豬崽子～
在生物信息學領域,經常需要根據(jù)基因名稱匹配其對應的編號,本文介紹了一種通過字典進行基因名稱與編號匹配的方法,首先定義一個空列表存儲對應編號,對于字典中不存在的基因名稱,其編號默認為0
1. 問題描述
如下左圖為編號與gene名稱的對應關系（此處僅顯示前10條），已存為字典（map_gene）
右圖為我們需要去匹配的gene名稱，如何根據(jù)基因名稱給出對應的編號？
2. 解決方案
2.1 定義變量
首先，我們定義一個空的list來存儲gene對應的編號，且因部分gene在字典map_gene中不存在，故需記錄可匹配到的個數(shù)。
# 定義變量 m = [] # 存儲對應編號的list t = 0 # 記錄map_gene中可以匹配到的gene個數(shù) n = 0 # 記錄map_gene中不存在的gene個數(shù)
2.2 匹配gene對應的編號
# 遍歷gene列表，若在map_gene中可匹配到，則保存對應編號；否則返回0.
for i in range(len(gene)):
if gene[i] in map_gene.keys():
m.append(map_gene[gene[i]])
t = t+1
else:
m.append(0)
n = n+12.3 將匹配好的結果導出存為csv格式
# 導出到csv
data = np.vstack(gene,m)
df = pd.DataFrame(data)
df.to_csv('gene_match.csv')csv文檔截圖如下，僅選取0-20gene展示結果，其中第18個gene rutr在gene_map中無匹配，故編號為0.
總結
匹配成功，撒花完結。
以上為個人經驗，希望能給大家一個參考，也希望大家多多支持腳本之家。
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