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Python處理mat文件的三種方式小結(jié)

 更新時間:2022年05月11日 09:57:17   作者:石頭之心  
這篇文章主要介紹了Python處理mat文件的三種方式小結(jié),具有很好的參考價值,希望對大家有所幫助。如有錯誤或未考慮完全的地方,望不吝賜教

處理mat文件的三種方式

讀書的時候,處理數(shù)據(jù)都是采用matlab,但畢業(yè)后當(dāng)了程序員,matlab從此在自己的電腦上消失了(安裝包太大,還要license,啟動也好慢,不符合程序員的需求)。

但是最近公司仿真的數(shù)據(jù)是以matlab的.mat格式存儲的,需要讀取出來處理,那就找找python相關(guān)的庫吧,沒有python干不了的活?。?!

mat文件存儲了matlab中變量數(shù)據(jù),因此,python讀出的mat數(shù)據(jù)是以k-v形式存儲在字典里,key是變量名,value是數(shù)據(jù)內(nèi)容:

scipy

最先想到的的是scipy工具

import scipy.io as scio
data = scio.loadmat(‘example.mat')
data[‘loss']

但是讀取有的.mat文件的時,會拋出異常(v7.3版本):

raise NotImplementedError('Please use HDF reader for matlab v7.3 files')NotImplementedError: Please use HDF reader for matlab v7.3 files

h5py

遇到上面的問題,就需要采用h5py庫了:

import h5py
data=h5py.loadmat('example.mat') ??
data['loss'][:]

但是這樣讀出來的是file格式,調(diào)試的時候都很難知道key是什么,取數(shù)據(jù)可以按照key來取,但是前提是需要知道key值,不方便獨立調(diào)試。

mat73

今天的主角登場,個人覺得mat73兼容性最好,幾乎所有的mat文件都能成功讀取,而且讀取的結(jié)果是k-v的字典,很便于后續(xù)處理:

import mat73
data=mat73.loadmat(path) ??
data['loss']

mat4py

不推薦,兼容性較差,可能是沒有后續(xù)更新。

總結(jié):總的來說,個人比較推薦使用mat73,兼容各種版本的mat文件,其次可以比較清晰的看到mat文件中保存數(shù)據(jù)的key值,便于后續(xù)的提取。 

python操作.mat文件

在win10中,打開

ITC_VD 數(shù)據(jù)集格式,

結(jié)果在訓(xùn)練集ITC_VD_Training_Testing_set中,看到標(biāo)簽文件全是快捷方式,

選中一個文件,右鍵 屬性,看到:

Microsoft Access Table Shortcut (.mat)

查了半天,發(fā)現(xiàn)是.mat 的 matlab格式,

python讀取.mat格式

from scipy.io import loadmat??
m = loadmat(r"E:\data\yolov5_dbb\ITC_VD_Training_Testing_set\Training\GT/00064.mat")
?
daaa=m.keys()
print(daaa)
?
print(m['x00064'])

.mat 文件里的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)是 dict ,所以取值要按照 key:value 的形式:

上面讀出來的數(shù)據(jù)是 ndarray 類型,為了方便數(shù)據(jù)的展示,我們可以將其轉(zhuǎn)換為,pandas的DataFrame:

import pandas as pd
?
df = pd.DataFrame(m['H_BETA'])
?
df.head()

mat轉(zhuǎn)圖片

import glob?
import cv2
import numpy as np
?
r_path=r'C:\File\2021-11'
?
files=glob.glob(r_path+"/*.mat")
from scipy.io import loadmat?
?
# 數(shù)據(jù)矩陣轉(zhuǎn)圖片的函數(shù)
def MatrixToImage(data):
? ? # data = data * 255
? ? new_im = data.astype(np.uint8)
? ? return new_im?
?
for file in files:
?
? ? if "2018" in file:
? ? ? ? continue
? ? print(file)
? ? m = loadmat(file)
?
? ? daaa = m.keys()
?
? ? data=m['groundTruth']
?
? ? print(data)
?
? ? new_im = MatrixToImage(data)
? ? cv2.imshow("asdf",new_im)
? ? cv2.waitKey()
?
? ? # print(data)

以上為個人經(jīng)驗,希望能給大家一個參考,也希望大家多多支持腳本之家。

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