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python 將dicom圖片轉(zhuǎn)換成jpg圖片的實(shí)例

更新時(shí)間：2020年01月13日 15:27:33 作者：GoHowz

今天小編就為大家分享一篇python 將dicom圖片轉(zhuǎn)換成jpg圖片的實(shí)例，具有很好的參考價(jià)值，希望對(duì)大家有所幫助。一起跟隨小編過來(lái)看看吧

主要原理：調(diào)整dicom的窗寬，使之各個(gè)像素點(diǎn)上的灰度值縮放至[0,255]范圍內(nèi)。

使用到的python庫(kù)：SimpleITK

下面是一個(gè)將dicom（.dcm）圖片轉(zhuǎn)換成jpg圖片的demo：

import SimpleITK as sitk
import numpy as np
import cv2

def convert_from_dicom_to_jpg(img,low_window,high_window,save_path):
  lungwin = np.array([low_window*1.,high_window*1.])
  newimg = (img-lungwin[0])/(lungwin[1]-lungwin[0])  #歸一化
  newimg = (newimg*255).astype('uint8')        #將像素值擴(kuò)展到[0,255]
  cv2.imwrite(save_path, newimg, [int(cv2.IMWRITE_JPEG_QUALITY), 100])

if __name__ == '__main__':

  # 下面是將對(duì)應(yīng)的dicom格式的圖片轉(zhuǎn)成jpg
  dcm_image_path = '/DICOM_image/lung001.dcm'    #讀取dicom文件
  output_jpg_path = 'JPG_image/lung001.jpg'
  ds_array = sitk.ReadImage(dcm_image_path)     #讀取dicom文件的相關(guān)信息
  img_array = sitk.GetArrayFromImage(ds_array)   #獲取array
  # SimpleITK讀取的圖像數(shù)據(jù)的坐標(biāo)順序?yàn)閦yx，即從多少?gòu)埱衅絾螐埱衅膶捄透?，此處我們讀取單張，因此img_array的shape
  #類似于 （1，height，width）的形式
  shape = img_array.shape
  img_array = np.reshape(img_array, (shape[1], shape[2])) #獲取array中的height和width
  high = np.max(img_array)
  low = np.min(img_array)
  convert_from_dicom_to_jpg(img_array, low, high, output_jpg_path)  #調(diào)用函數(shù)，轉(zhuǎn)換成jpg文件并保存到對(duì)應(yīng)的路徑
  print('FINISHED')

以上這篇python 將dicom圖片轉(zhuǎn)換成jpg圖片的實(shí)例就是小編分享給大家的全部?jī)?nèi)容了，希望能給大家一個(gè)參考，也希望大家多多支持腳本之家。

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